Le poisson élevé peut être mangé dans un régime alimentaire équilibré. Ce, sans risque pour la santé humaine de souffrir de  traces de dioxine ou de composés y relatifs qui seraient présents dans le poisson. le poisson vivant dans un environnement naturel, toute trace de dioxine en serait la résultante.

Actuellement, les principales données présentes concernent le saumon. Pour une même région, le taux de dioxines mesuré dans le saumon élevé est plus faible, similaire dans certains cas, à celui du saumon sauvage de la même région.

Les dioxines, et autres composés semblables, apparaissent naturellement dans l'environnement mais leur présence a été augmenté par les activités humaines. Cependant, les niveaux trouvés, habituellement, dans la nourriture sont si petits que les dioxines doivent être mesurées en picogrammes (un million d'un million de grammes ; Soit 0,000000000001 gr) par kilo de poisson.

Quand on a reconnu la menace potentielle de ces composés envers l'environnement et la santé humaine, des démarches ont été réalisées pour les éliminer ou les réduire. Dans les années 1980, les niveaux ont, ainsi, commencé à diminuer et continue à diminuer. Par exemple, l'agence américaine de protection de l'environnement déclare, dans son rapport intitulé " Rapport de réévaluation de la dioxine", qu'une chute de 80 % a été observée depuis 1980, date à laquelle ces systèmes de monitoring et de contrôle ont été mis en place. Un rapport de l'Union européenne, intitulé "Avis du Comité Permanent sur l'alimentation à propos de l'évaluation des risques de la dioxine et des PCBS dans l'alimentation" (novembre 2000), signale également que, depuis 1980, l'exposition alimentaire aux dioxines a diminué de près de 50 % dans certaines pays européens. Les niveaux sont, donc, beaucoup plus faibles que durant les années 1960 et 1970 ; Ce qui est encourageant.

En réponse aux préoccupations du consommateur, les principales sociétés industrielles d'alimentation ont pris des mesures pour réduire encore plus la dioxine dans les poissons d'élevage. Ce, en modifiant leur régime alimentaire grâce à une des préoccupations principales : n'importe quel changement diététique doit avoir un impact minimal sur les niveaux d'acides gras, de type oméga-3 polyinsaturé, relatifs à la santé et présents dans le poisson.

La connaissance spécialisée, des compagnies alimentaires, dans la composition d'huiles de poisson sera appliquée pour conserver ces niveaux. On commence à apporter des preuves, substantitelles mais grandissantes, que les acides gras Oméga 3 ont des bénéfices significatifs sur la santé. Ces avantages vont des bénéfices pour la santé cardiovasculaire et le soulagement des douleurs liées à l'arthrite jusqu'à des preuves dans la prévention des cancers ainsi qu'un rôle central dans la santé mentale et le fonctionnement du cerveau (voir la section Nutrition pour plus de détails).

En tant qu'élément d'un régime alimentaire sain et comme recommandé par des associations (e.g. l'agence britannique des normes alimentaires), si une personne, de 70kg, mangeait une portion moyenne de 130gr de saumon par semaine, sa consommation en dioxines ne représenterait qu'un dixième des prises tolérables indiquées par la commission européenne et l'organisation mondiale de la santé. Ce, basé sur les niveaux de traces de dioxines et PCBS trouvés dans le saumon cultivé disponible en Europe. La dose journalière tolérable édictée par l'OMS se situant entre 1 et 4 picogramme par kg de poids corporel. Cette dose est internationalement reconnue comme valeur de référence pour assurer que les taux d'exposition sans danger ne sont pas dépassés.

Des réductions suplémentaires du taux de dioxines dans les aliments et, par conséquent, dans le poisson cultivé peuvent être obtenues en utilisant des matières premières des régions du monde où les niveaux ambiants sont les plus bas.

Une autre possibilité, pour réduire encore les taux de dioxines, est l'utilisation d'huiles végétales combinée à l'utilisation d'huiles de poissons.

Enfin, plusieurs des principales sociétés d'alimentation participent aux essais concernant la suppression des dioxines dans les matériaux bruts ainsi que les effets de tels traitements sur les valeurs nutritionnelles des aliments.