Les espèces de poissons pélagiques sont les plus utilisées pour la fourniture d'huile et de farine de poissons. Elles ne conviennent pas à l'alimentation humaine car ces poissons sont petit et osseux. Il serait ne serait, donc, pas viable économiquement de les traiter pour répondre aux besoins du consommateur.

Ils sont attrapés près des côtes du Pérou et du Chili ainsi que dans la Mer du nord, l'Atlantique nord et la Mer Baltique.

Récemment, il a été insinué que ces espèces étaient surpêchées. Pourtant, un rapport de l'organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO), intitulé La situation mondiale des pêches et de l'aquaculture (2002), signale qu'il y a, seulement, 18% des principaux stocks ou groupes d'espèces qui sont surexploités. Les espèces classifiées comme surpêchées sont d'une grande longévité, de croissance lente et moins susceptible de supporter des hauts niveaux d'exploitation que les espèces à croissance rapide et de courte longévité. Ces dernières étant utilisées, de manière prédominante, pour l'huile et les farines de poissons.

Le Chili et le Pérou ont des contrôles gouvernementaux stricts pour prévenir la surpêche : des arrêts de pêche sont imposés et l'ordre est maintenu par un système de dépistage des bâteaux. Ils gèrent activement leur pêche et maintiennent un contact serré avec les organisations internationales qui contrôlent les stocks de poissons. Ils conduisent, aussi, leurs propres recherches en maintenance et développement de stock.

En 1998, El Niño, faisant partie des pires ouragans qui aient jamais été enduré, a eu un impact significatif sur le nombre de poissons vivant dans les mers du Pérou et du Chili. Cependant, une fois que cela a été fini, les stocks de poissons pélagiques se sont remis rapidement grâce à leur nature même (à savoir : croissance rapide, longévité courte) et la protection mise en place par les contrôles du gouvernement. Cette expérience a démontré la durabilité de cette ressource. Des données récentes de l'IMARPE, l'unité de recherche pour le contrôle des stocks de poissons du gouvernement péruvien, confirme que la ressource d'anchois (utilisée pour la farine de poissons et la production d'huile de poissons) se porte dans des conditions biologiques saines. Les statitiques de prise actuelles confirment cette conclusion.

La pêche mondiale est stable : près de 95 millions de tonnes par an. Approxivement un tiers de cette production est utilisée pour la farine et l'huile de poissons. Ce tiers est constitué par les "déchets" ou "sous-produits" du poisson (les abats; la tête...) enlevés lors de la conversion du poisson pêché en produit de consommation alimentaire pour l'être humain. Nous croyons qu'il y a toujours un potentiel pour augmenter de manière significative la contribution faite à partir de sous-produits, de l'industrie du traitement de poissons, si une plus grande attention lui était dédiée. La proportion utilisée, de la prise totale de poissons, pour la farine et l'huile de poissons n'a pas changé durant l'expansion de l'aquaculture commerciale. Une des raisons en est que le niveau de farine de poissons dans l'alimentation pour poissons a été réduite lors du développement de meilleures formules de diététique.

La production totale de farine de poissons est de près de 6,5 millions de tonnes par an. De cela, l'aquaculture utilise 2 millions de tonnes, soit 31 %. La production totale d'huile de poissons varie entre 1 et 1,2 millions de tonnes et l'aquaculture en utilise 40 %. Si l'expansion de l'aquaculture augmente la demande en farine et huile de poissons, il est très probable que ce sera réalisé par un changement des marchés.

Effectivement, pour le moment, les deux tiers restant, de farine de poissons produite, sont utilisées pour les animaux terrestres. Une augmentation des quantités de farine de poissons utilisée dans la nourriture pour poissons passera plus probablement par une réduction de la quantité utilisée pour l'alimentation des porcs et de la volaille. Ce, plutôt que par une augmentation de la prise de poissons pélagiques ou une augmentation de la proportion de la prise totale utilisée pour ces produits.

Des investissements considérables ont été faits dans la recherche pour trouver des alternatives à ces farines et huiles de poissons de haute qualité. Maintenant, nous savons que les sources de protéines végétales raffinées peuvent être utilisées et qu'elles sont aussi bonnes pour la santé, la croissance et la qualité des poissons que toute autre protéine. Une demande supplémentaire en huiles sera probablement rencontrée par un complément d'huiles végétales.